Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.4 ms