Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SCAMP3O14828 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms