Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms