Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LRP12Q9Y561 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms