Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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