Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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SAMD8Q96LT4 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SAMD8Q96LT4 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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