Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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