Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PDGFDQ9GZP0 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PDGFDQ9GZP0 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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