Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL050402.1-201ENST00000440477 770 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL17P3-201ENST00000605695 525 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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