Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TAF1AQ15573 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms