Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms