Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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UBXN4Q92575 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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