Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDKN3Q16667 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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