Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms