Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4AQ13619 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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