Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SREBF2Q12772 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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