Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ACADSBP45954 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms