Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB6CQ53S08 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB6CQ53S08 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms