Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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HDAC6Q9UBN7 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDAC6Q9UBN7 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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