Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CUL1Q13616 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CUL1Q13616 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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CUL1Q13616 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CUL1Q13616 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL1Q13616 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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