Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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