Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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SYCP1Q15431 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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