Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP53609 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP53609 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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