Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SP6Q3SY56 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms