Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTCH1Q13635 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTCH1Q13635 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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