Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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