Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TWF1Q12792 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms