Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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