Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r25W4VSP2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r25W4VSP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r25W4VSP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn2r25W4VSP2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms