Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mbd3Q9Z2D8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms