Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms