Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms