Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin2Q9WVE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms