Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx1Q9WV80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx1Q9WV80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms