Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gpc6Q9R087 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc6Q9R087 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms