Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms