Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc3Q9QZC1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms