Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms