Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr5Q9JLF7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms