Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms