Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms