Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms