Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms