Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms