Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms