Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SgshQ9EQ08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms