Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx6Q9DBY5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx6Q9DBY5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms