Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9DAE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9DAE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9DAE8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9DAE8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9DAE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms