Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smco2Q9DA21 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms