Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SlirpQ9D8T7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SlirpQ9D8T7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms